（一）食管
1.胃食管反流病Eliakim等首次报道有了有关食管胶囊内镜（ECE）对食管疾病的诊断价值，认为ECE是一种准确、安全、简便、依从性较好的筛查及诊断工具。虽然食管胶囊内镜具有安全、无痛苦等优点，但其是否能取代常规胃镜成为胃食管反流病（GERD）患者筛查Barrett食管的一线诊断手段，至少目前答案是否定的。一项包括9项临床研究的荟萃分析提示：食管胶囊内镜及常规食管胃十二指肠内镜在GERD患者中筛查Barrett食管的敏感性和特异性为77%vs.78%，86%vs.90%。该项荟萃分析得出如下结论：在GERD患者中，食管胶囊内镜诊断Barrett食管仅具有中度的敏感性和特异性，且其无法对病变进行活组织检查，因此常规食管胃十二指肠内镜仍作为目前评估疑似Barrett食管患者的首选检查方法。
2.食管静脉曲张ECE检查是无须充气，目前尚无专门用于ECE对食管曲张静脉的分级标准。一项包括7想临床研究的荟萃分析表明：ECE在检查食管静脉曲张的敏感度、特异度较为满意，分别为85.8%（p=0.01)和80.5%（p＜0.01），但尚没有足够的资料显示ECE对确诊食管静脉曲张的诊断价值。
(二）小肠
1.不明原因消化道出血在诊断小肠病变方面，胶囊内镜一直被证明优于推进式小肠镜（PE）和小肠造影检查。一项纳入14项研究的荟萃分析显示，胶囊内镜的检出率是PE的双倍（63%vs.28%），研究也发现胶囊内镜检出率同样高于小肠造影方法（42%vs.6%）。另外一项汇总24项研究（例）数据的荟萃分析同样支持这一结果，该报告指出胶囊内镜、PE及小肠造影的检出率分别为87%、14.8%、和9.9%。综合多项前瞻性研究结果表明，胶囊内镜对不明原因消化道出血的总体诊断率在47%~74%之间。由于其灵敏度高，胶囊内镜检查是不明原因消化道出血患者首选的诊断方法。一项对胶囊内镜与术中小肠镜的比较研究结果显示，胶囊内镜对不明原因消化道出血诊断的敏感度、特异性、阳性预测和阴性预测值分别为95%、75%、95%和86%，胶囊内镜所发现的做常见的消化道出血原因为血管病变和克罗恩病，其他有小肠肿瘤等。最新一篇系统分析纳入了个CE的研究，汇总表明：不明原因消化道出血（OGIB）是迄今为止胶囊内镜检查最常见的适应症（占66%），其中最常见的病变是血管发育异常（50%)，其次是溃疡（26.8%）和肿瘤性病变（8.8%）。有调查显示，胶囊内镜可能无法识别一些没有累及粘膜的小肠肿瘤，如类癌或胃肠道间质瘤等。Ross等学者报道胶囊内镜在此类小肠肿瘤中的假阴性率达67%。JamesEHuprich等（）的一项研究表明，多项CT小肠成像在检测小肠病变引起不明原因消化道出血的灵敏度高于胶囊内镜检查（88%vs.38%,p=0.),而这一差别主要是因为小肠CT较胶囊内镜更易于描绘小肠肿瘤。因此，近年来的观点认为多相CT小肠成像也应在加入OGIB患者的常规诊断流程中综合考虑，尤其是既往胶囊内镜检查阴性的患者。
2.克罗恩病荟萃分析显示，胶囊内镜能检出小肠X线及CT等传统影像检查技术未能发现的早期病变，胶囊内镜亦明显扩大了检测病变的范围，充分证明了胶囊内镜在诊断小肠克罗恩病（CD）中的独特优势。医院曾对20例临床疑似小肠克罗恩病患者作了前瞻性焦昂内镜检查研究，这些患者伴有不同程度的腹痛、消瘦、大便潜血阳性、缺铁性贫血、腹泻或发热等症状或体征，并且在入组前经小肠X线钡餐、胃镜及结肠镜等检查均未发现异常。入组前患者平均症状持续时间为6.5年。结果20例种经胶囊内镜检查共发现克罗恩病13例，检出率为65%，病变包括粘膜糜烂（2例）、口疮样溃疡（5例）、结节样病变（1例）、大溃疡（2例）和溃疡伴肠腔不完全狭窄（3例）。据最新文献报道，对于已经确诊为CD者患者可疑小肠复发者，CE相对于其他检查方法在诊断率上有明显的优势。然而，对于可疑CD新发病者，后续分析显示CE的诊断率与其他检查方法无明显统计学差异。此外，一项关于CE和结肠镜检查克罗恩病术后复发情况的对比研究发现，CE的敏感性低于结肠镜，检查末端回肠复发时结肠镜是首选工具。
胶囊内镜可用于小肠克罗恩病的初次诊断、监控疾病的复发、明确病变的范围和严重程度、评估对治疗的反应并可对未定型结肠炎加以明确，因此有助于对克罗恩病患者早期治疗并根据检测的病变程度和范围而及时调整治疗方案。
3.小肠肿瘤多项研究表明，胶囊内镜诊断小肠肿瘤的敏感性达55%~76%，检出率为1.6%~11.6%，远高于其他小肠传统检查方法。在胶囊内镜问世之前，人们普遍认为小肠肿瘤发病率极低，放射影像学细聊显示发现率仅占所检患者的1%，而胶囊内镜的临床应用明显提高了小肠肿瘤的诊断率。
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