由于胃食管反流破坏了正常的鳞状上皮之后，导致对消化液有较强抵抗能力的化生性柱状上皮形成的一种病理过程。在这一病变的基础上，经常发生消化性溃疡、食管狭窄、肠上皮化生、异型增生，直至腺癌。
be本身并无症状，其症状主要是由于胃食管反流及其并发症所引起的。多数患者最初有gerd症状，如胃灼热、反流、咽困难。常见症状多见于餐后及做某些动作引起反流时，弯腰、腹内压升高或夜间睡眠时可出现胸骨后烧灼样不适以及胸痛。胸痛可表现在剑突下或胸骨后，疼痛性质可呈烧灼样、针刺样或类似心绞痛，疼痛可通过饮食或服用抗酸药物缓解。多数be患者没有因食管症状而就诊。
一般来讲，be的症状比无be的胃食管反流病症状要轻，原因是barrett上皮比鳞状上皮更耐受消化性酸的侵袭。反酸、反胃是严重胃食管反流症状，胃肠内容物反流入食管可进入口腔，口内可有酸味或苦味，出现口臭、味觉损害、咽痛、慢性咽炎、声嘶、牙釉质腐蚀等现象。反流症状的轻重与be程度无确定关系。部分患者有贫血或上消化道出血，如出现食管溃疡和狭窄，则表现为吞咽痛和相应的梗阻症状。吞咽困难的原因可能为鳞状上皮与柱状上皮交界处狭窄、慢性食管炎所导致的食管壁纤维化、食管蠕动功能减弱、急性炎症引起的食管痉挛或柱状上皮癌变、腺癌引起的食管腔梗阻。还有患者伴有严重反流，表现为呼吸系统并发症，如反复哮喘发作、慢性支气管炎、吸入性肺炎和肺间质纤维化等。
